En Palestine, Médecine pour le Tiers Monde soutient les Health Work Committees (HWC), une ONG locale active à Jérusalem-Est et en Cisjordanie. Le contexte : la confrontation quotidienne avec l'occupation, la colonisation et la répression israéliennes.
Dans la bande de Gaza, HWC a une organisation-sœur, l'Union of Health Work Committees. Face à la situation de blocus, d'agression militaire et de guerre, Médecine pour le Tiers Monde soutient régulièrement l'UHWC avec de l'aide d'urgence, entre autres à destination de l'hôpital Al-Awda.